在硅藻土过滤法中，硅藻土自身具有许多天然的小孔，滤层中不规则的孔道较长，且密集分布于整个滤饼层，从而可以吸附容纳较多的微细粒子，从而提高过滤的质量。
硅藻土过滤的原理是滤液体，在泵压力作用下，通过预涂层而进入收集腔内，颗粒及高分子被截流在预涂层，进入收集腔内的澄清液体，通过中心轴，流出容器。过滤器是由滤网、支撑网及外框架三部分构成的。每个滤元是一根带孔的管作为骨架，外表面缠丝，丝上涂硅藻土覆盖层。滤元固定在隔板上，隔板上下为原水室和清水室。整个过滤周期分铺膜、过滤和反冲洗三步。
滤膜厚度一般为2-3mm，硅藻土粒度为1-10μm。过滤结束后常采用水或压缩空气或两者用进行反冲没门过滤的优点是处理效果好，冲洗水量小(小于1%生产水量)，占地面积小(小于10%普通砂滤池面积)。比陈旧棉饼过滤有明显的优势：能源可节约92%，酒损失减少90%，设备成本节约2/3，生产工人减少3/4。
使用硅藻土过滤后的酒和饮料，风味不变，无毒、无悬浮物、沉淀物、澄清透明、滤清度高、占地面积小、轻巧灵活、移动方便。选用的主要控制参数为壳体材料、壳体工作压力、直径、助剂用量、反冲洗强度等。
硅藻土过滤的费用低：用水量：反冲洗用水量是砂滤机的1/10;用电量：总用电负荷只有传统砂缸过滤系统机房的总用电负荷的3/5左右;用药量：在过滤时需加硅藻土，每平方米过滤面积，每一个过滤周期投加量为0.2公斤。
